Desenvolvimento de um sistema de software para contagem de vasos em pesquisa de angiogênese

Abstract

Novos fármacos devem passar por testes que verificam seus efeitos sobre o desenvolvimento do sistema vascular. Para realizar tais testes, é comum que estes fármacos sejam postos em um pellet e então sejam inseridos em um ovo de galinha fecundado. Neste ovo são testados os efeitos dos fármacos sobre o desenvolvimento do embrião. Para verificar a receptibilidade e efeitos do fármaco, é aberta uma pequena janela no ovo e então ele é posto em um microscópio especializado para que sejam contados manualmente todos os vasos sanguíneos que se conectaram ao pellet. Porém, esta tarefa se mostra laboriosa e improdutiva. Diante deste cenário, é proposto o desenvolvimento de um sistema empregando visão computacional capaz de, a partir de fotos tiradas do microscópio, automatizar a rotina de análise das imagens adquiridas das amostras adquiridas. Para tal foi desenvolvido um método de esqueletonização e contado os vasos em torno do pellet assim como a densidade de vasos e o número de vasos por milímetro no pellet. Assim foi feito um sistema que conseguiu contabilizar de forma confiável os dados requisitados.

New drugs must undergo tests that verify their effects on the development of the vascular system. To perform such tests, it is common for these drugs to be placed in a pellet and then inserted into a fertilized chicken egg. In this egg the effects of the drugs on embryo development are tested. To check for drug receptivity and effects, a small window is opened in the egg and then placed under a specialized microscope to manually count all blood vessels that have connected to the pellet. However, this task is laborious and unproductive. Given this scenario, it is proposed to develop a system employing computer vision capable of automating the routine of analysis of acquired images from acquired samples. For this, a skeletonization method was developed and the vessels around the pellet counted as well as the vessel density and the number of vessels per millimeter in the pellet. Thus was made a system that could reliably count the requested data.